Fakultas Ekonomi merupakan salah satu fakultas tertua di Universitas Samudra yang telah lahir sejak tahun 1971 di bawah naungan Yayasan Pendidikan Samudra. Setelah lebih 40 (empat puluh) tahun berkiprah sebagai bagian dari sebuah perguruan tinggi swasta. Pada tahun 2013, Fakultas Ekonomi mengalami transformasi seiring penetapan Universitas Samudra sebagai Perguruan Tinggi Negeri berdasarkan Peraturan Presiden Republik Indonesia Nomor 37 Tahun 2013 tentang Pendirian Universitas Samudra. Setelah penegerian tersebut, Fakultas Ekonomi membuka Program Studi Baru yaitu Program Studi Akuntansi. Bersama Program Studi sebelumnya, yaitu Program Studi Ekonomi Pembangunan dan Program Studi Manajemen. Fakultas Ekonomi terus berkiprah dalam menghasilkan sumber daya manusia dalam bidang ilmu ekonomi dan bisnis.